植物保护一级学科是2005年批准设立的博士学位授予点，其中二级学科农药学专业于1998年获得硕士学位授予权。与国内同类学科比较，近年来在农药分子设计、农药合成化学、生物农药与农药生物化学等方面具有优势和鲜明的研究特色。具体表现为：在国际上发表论文数（SCI）及其引用数居领先地位；科研成果获奖数及其级别均居突出地位；科技成果转化成绩显著；承担的国家项目名列前茅；一批年轻学术带头人涌现, 其中一人获得国家杰出青年基金，一人已受聘教育部长江学者特聘教授，一人获得教育部跨世纪人才计划资助，一名入选"百千万"工程，一人获得上海市科技精英称号，三人获得曙光计划资助。
本专业现有教授11人，副教授7人。主要研究有：绿色化学农药创制、基于受体结构的分子设计及定量构效关系研究、农药品种及重要农药中间体的开发、生物农药研制及产业化开发、新型潜在高效杀菌剂的筛选、发现与应用、生物活性测试及毒理学研究。
一、培养目标
植物保护一级学科的硕士学位获得者要熟悉本学科的发展现状、方向以及国际学术研究前沿；掌握本学科基础理论和专业知识；熟练运用电子计算机及先进仪器设备。具备严谨求实的科学态度，独立从事与植物保护有关的工艺研究、毒理研究及新产品开发的能力；至少精通一门外国语，能熟练地阅读本学科该语种的外文资料，并具有一定的应用该语种写作的能力和进行国际学术交流能力；并具有较好的管理工作的能力。能胜任高等院校、科研院所、企业和其他单位的教学、科研和技术管理工作。
二、学制和学习年限
硕士生的学制为2．5年，学习年限不超过5年，课程学习学分有效期自研究生入学开始为5年。
三、研究方向
1． 农药生物信息学
2． 农药合成化学
3． 生物农药
4． 昆虫毒理学
5． 植物病害生物防治与微生物农药
6． 杀菌剂毒理与应用
四、培养计划
研究生应在入学后一个月内，在导师组及导师的指导下制定培养计划，包括课程学习和学位论文工作计划。学位论文工作包括研究方向，已有工作基础，研究计划和时间安排等。
五、课程设置
（一）总学分
本学科硕士生应完成不少于27学分的课程学习，一般在入学后的3个学习单元内完成。
提倡硕士生自主学习和研究型学习，提高创新能力。鼓励硕士生在进行课程学习的同时，参与课题组的科学研究与学术活动，开展学位论文的前期工作。
