东南大学自1952年全国高校院系调整后就开始招收研究生，50年代后期和60年代初期共招收研究生117人，1978年恢复招收研究生，1981年实施学位条例后， 是首批获学士、硕士、博士学位授予的单位；是首批建有博士后流动站的单位；是首批通过国家"211工程"部门预审并获国家立项资助的大学之一；是自行审批硕士点、自行审定增列博士生指导教师的试点单位之一； 也是首批获准招收和培养工程硕士生的单位之一。1986年4月经国务院批准试办研究生院，1996年3月经国家教委批准，正式建立研究生院。 现有中国科学院院士1名、中国工程院院士10名、博士生指导教师460多名、硕士生指导教师1100多名。东南大学和许多重点高校一样，已成为我国研究生培养的一个重要基地。
东南大学现有16个一级学科博士学位授权点，96个博士点，30个一级学科硕士学位授权点，209个硕士点，覆盖现有研究生学科、专业目录中的12个门类的哲学、经济学、 法学、教育学、文学、理学、工学、医学、管理学等9个门类。
20多年来，东南大学共招收博士生5224名；硕士生24057名，其中MBA848名；在职人员攻读硕士学位招生6390名。已授博士学位2404名，硕士学位18997名，其中以同等学力申请博士学位9名， 同等学力申请硕士学位312名,建筑学硕士266名,工程硕士专业学位1528名，工商管理硕士专业学位1203名，中职教师在职人员攻读硕士学位297名,高校教师在职人员攻读硕士学位60名,公共卫生硕士专业学位22名。
总结过去，面向未来，解放思想，实事求是，处理好巩固和发展的关系，努力使研究教育适应我国经济的突飞猛进、科技的日新月异和全球范围的激烈竞争。抓住有利时机，深化改革，迎接挑战，争取再上一个新台阶，为探索建设有中国特色的高层次社会主义新型大学积累新的经验，为21世纪学位与研究生教育做出新的贡献。
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