根据中华人民共和国教育法，在职研究生学历教育不属义务教育范畴。因此，接受在职研究生学历教育的人员有义务分担全部或部分培养费用。
在职研究生学历教育是一项高投入、高成本的教育活动。在职研究生学历教育是人才培养的最高层次。在教育过程中，需要高水平的教师、良好的教学环境、先进的科研手段、完备的信息体系。不同于本科生的批量培养模式，在职研究生学历在攻读学位过程中从事的是相对独立的学习和科研活动，指导教师对在职研究生学历的指导一般情况下只能是单体培养模式。为了完成高质量的学位论文，在职研究生学历在攻读学位期间一般从事本学科领域前沿的、带有创新性或攻关性的科研活动所有这些因素决定了在职研究生学历教育是一项高投人的教育活动。根据哈尔滨工业大学财务处提供的学生培养成本核算数据，如只是考虑学校投人到在职研究生学历教育中的一般培养费用，按照生均一般培养成本/年=(教育事业支出+房屋折旧铆/年学生人数的公式测算(其中教育事业支出包括:人员费用支出，日常公用支出，固定资产购建和大修理支出)，则目前工科博士生的一般培养费用约为4.0万元/生。年，工科硕士生约为3.0万元/生·年。如同时考虑在实际在职研究生学历培养工作中学校和导师支付的科研条件费用，则工科博士生的培养成本约为7.0万元/生·年，工科硕士生约为5.0万元/生·年。
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按照国际惯例，多数国家在职研究生学历教育的成本都是由多渠道承担。
国家投人的在职研究生学历教育经费不能满足实际需要。尽管国家对发展在职研究生学历教育非常重视，近年来对在职研究生学历教育的投人增加也很大，但对多数学校来说，国家拨付的在职研究生学历教育经费只能覆盖实际在校在职研究生学历培养费用的50%左右，远远不能满足需要。
