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福建农林大学的兽医学学科开设于2011年3月，包括基础兽医学、预防兽医学和临床兽医学三个二级学科，是福建省省级重点学科。
在2017年12月28日，教育部学位与研究生教育发展中心公布全国第四轮学科评估结果中，福建农林大学的兽医学学科评估结果为C-，排在全国该专业的60%-70%。
三个二级学科中的临床兽医学专业教学团队是2009年的省级教学团队，科研上学校有福建省兽医中药与动物保健重点实验室、中西兽医结合与动物保健福建省重点高校实验室，在福建省内科研实力不俗。
就业上来看，福建农林大学的总体就业率为97.12%，兽医学硕士的就业率目前未有公开。
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